澳门高等教育虽然起步较晚，直到1981年才由中国人自主创办东亚大学，但澳门回归祖国以来，在中央政府和祖国内地大力支持下，高等教育实现了跨越式发展。目前，澳门共有10所高校，高等教育课程总数390个，其中学士课程126个，硕士课程156个，博士课程96个，其他课程12个。在校学生62000多人，教学人员3700多人，分别是1999年的7.3倍、4.5倍。
近年来，澳门高校办学质量不断提高，国际知名度和影响力大幅提升。澳门大学于2009年获批准在横琴建设新校园，并授权由澳门依照特别行政区法律实施管辖。2014年澳门大学全面迁入新校园，校园面积约一平方公里，是凼仔旧校园的20倍。最新数据显示，澳门大学在泰晤士高等教育世界大学排名第145位、全球年轻大学排名第14位、亚洲大学排名第34位；在葡萄牙语大学联会中名列第一；在QS世界大学排名285位；在《美国新闻与世界报道》（U.S. News & World Report）全球最佳大学排名第230位。今年6月，顶尖学术指标基本科学指标（Essential Science Indicators，以下简称ESI）最新统计数据显示，澳门大学工程学、计算机科学、药理学与毒理学三个学科领域从ESI学科全球排名前1%跃升至前0.1%，进入世界顶尖学科的前列。
澳门大学校园
澳门理工大学作为澳门首家及唯一连续两度荣获“国家级教学成果奖”、全国唯一四度荣获“亚太教育质量奖”的高等院校，教研质量获得国家及国际广泛认可，在2024年泰晤士高等教育世界大学排名第301至400名区间。澳门科技大学作为澳门回归祖国后创立的第一所大学，与特别行政区同成长、共发展，已成为澳门在校学生规模最大的综合型大学，在2024年泰晤士高等教育亚洲大学排名中位列第58位，世界年轻大学排名中位列第38位。澳门旅游大学在2023年QS世界大学“款待及休闲管理”学科排名中跻身全球前十（全球共有2477所院校参与款待及休闲管理学科排名评选），位列亚洲第一，是澳门本地高等院校首次夺得如此佳绩。